— Issu de la noble famille des Schaftholzheim, Jean fut membre de la province rhénosouabe de l'ordre de Saint-Augustin ; il fit sans doute sa profession au couvent de Strasbourg et termina ses études théologiques avec le grade de lecteur. Durant l'année 1350, il favorise la diffusion dans l'évêché de Strasbourg du Speculum manuale sacerdotum de son confrère Hermann de Schildesche † 1357 (DS, t. 7, col. 302-308). De 1356 à 1381, il assume la charge de vicaire pénitencier de l'évêque de Strasbourg. Il est signalé en 1373-1374 comme prieur du couvent de cette ville. On ignore le lieu et la date de sa mort.
Jean fut très proche du cercle spirituel des « Amis de Dieu » (DS, t. 1, col. 493-500) réunis autour de Rulman Merswin † 1382. Il a donné une version latine augmentée Le livre des neuf rochers, Neunfelsenbuch (mss : Stadtarchiv de Cologne, G. B. 4° 100, et Archives départementales du Bas-Rhin, H. 2184) ; on garde deux pseudo-lettres du légendaire Gottesfreund vom Oberland qui sont adressées à Jean de Schaftholzheim ; celle qui est datée de 1363 ne peut avoir été écrite avant les années 1369/70 ; elles ont été éditées par K. Rieder (Der Gottesfreund vom Oberland, Innsbruck, 1905, p. 122-125).
E. Sitzmann, Dictionnaire de biographie… de l'Alsace, t. 2, Rixheim, 1910, p. 659-660. — K. Bihlmeyer, Der selige Bruder Heinrich † 1396, eine unbekannter Strassburger Gottesfreund, dans Festschrift Sebastian Merkle, Düsseldorf, 1922, surtout p. 50-52. — Ph. Strauch, Merswins Neun-Felsen-Buch, Halle, 1929, p. IX-XIV (extraits de la trad. latine de Jean). —A. Zumkeller, Manuskripte von Werken der Autoren des Augustiner-Eremitenordens, Wurtzbourg, 1966, n. 581-583. — A. Kunzelmann, Geschichte der deutschen Augustiner-Eremiten, t. 2, Wurtzbourg, 1970, p. 20-22.
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